Здравствуйте, Илья! Разница этих предложений в том, что What is it like? - вопросительное предложение, а What it is like - часть придаточного предложения. Поэтому если вы хотите задать вопрос, то первый вариант предпочтительней:
1. What is it like?
либо 2) I wonder what IT IS like - как часть придаточного )))